“O Desporto Escolar constitui uma das vertentes de atuação do Ministério da Educação e Ciência com maior transversalidade no sistema educativo, desenvolvendo atividades desportivas de complemento curricular, intra e interescolares, dirigidas aos agrupamentos de escolas e escolas não agrupadas. (...)“ 

Compõe-se de um ”(…) conjunto de práticas lúdico-desportivas e de formação com objeto desportivo, desenvolvidas como complemento curricular e de ocupação dos tempos livres, num regime de liberdade de participação e de escolha, integradas no plano de atividade da escola e coordenadas no âmbito do sistema educativo. (...)

(...) Do ponto de vista funcional, o Desporto Escolar operacionaliza-se em duas vertentes complementares: uma, referente à dinamização de atividades desportivas realizadas internamente em cada agrupamento de escolas ou escola não agrupada; e outra, referente à atividade desportiva desenvolvida por grupos-equipa.

 Os grupos-equipa são organizados por escalão/género ou num escalão único e envolvem-se em competições interescolas com um nível de competitividade crescente: Campeonatos Locais, Campeonatos Regionais, Campeonatos Nacionais e Campeonatos Internacionais (...).”

(in Programa do Desporto Escolar 2013-2017)

O Agrupamento de Escolas D. Maria II oferece aos seus alunos a possibilidade da prática das seguintes modalidades: Andebol (Infantis B e Iniciados Masculino), Badminton (Vários Escalões Masculino e Feminino), Boccia (Vários Escalões Misto), Desportos Adaptados (Vários Escalões Misto), Natação (Vários Escalões Misto) e Voleibol (Infantis A, Infantis B, Iniciados, Juvenis e Juniores Femininos).